A Direção do NCP é exercida por dois responsáveis.
As competências atribuídas são:
Definir objetivos, estratégias e planos de ação, conforme a missão, visão e princípios;
Interagir com organismos de saúde, nacionais e internacionais, comunidade médica e educativa, indústria farmacêutica, autarquias e outras organizações afins;
identificar parceiros institucionais, stakeholders, interlocutores para apoios, financiamentos e contribuições;
Interagir com o Conselho Consultivo;
Promover a divulgação de informação científica em reuniões técnicas, webinars, ações de sensibilização, feiras da saúde, outras iniciativas, etc;
Colaborar, sempre que solicitado, com entidades que realizem projetos e estudos de investigação.